1986年6月在中国科协第三次全国代表大会上当选为科协主席，至1991年5月在中国科协第四次全国代表大会上辞去主席，当选为名誉主席，任期一届，共5年时间。
2007年国防工业出版社出版了10卷本《书信》。在《书信》第二卷上，看到钱老1984年9月28日给时任中国科协书记处书记鲍奕珊同志的信，使我回忆起钱老出任科协主席并不那么“顺利”的过程，令人起敬。
科协“二大”是1980年召开的，当时是科协下属的中国力学学会理事长和中国自动化学会理事长，并被推选为中国科协第二次全国代表大会的代表，出席了会议。大会结束时当选为副主席，周培源为主席。二届副主席还有严济慈、茅以升、钱三强等。
按科协章程规定，5年一届。所以从二届第四个年头，即1984年初就开始酝酿科协换届事宜。我因担任钱老的秘书，常常随他到科学会堂参加科协的会议，经历了换届的主要酝酿过程。
“这老爷子是真不想当主席，他在会上发火了”
1984年初，中国科协在周老主持下开过主席会议、常委会等。这些会议都谈到换届问题，大家一致推荐为下届主席候选人，但钱老本人坚决不同意。他甚至在会上和别人争得面红耳赤，决不退让。弄得周老和其他副主席十分难办。我作为钱老的秘书列席这些会议，在讨论人事安排问题时便“自觉地”退出会场，坐在走廊的长椅上休息。但会议室激烈争论的声音还是听得见的。科学会堂的服务员进去上茶，出来后对我说“这钱老爷子是真不想当主席，他在会上发火了，我在这儿当了这么多年服务员，还从没见过这种阵式”。
1984底，中国科协在周老主持下，召开二届五次全国委员会会议。大会在京丰宾馆召开。会议安排的主要日程是：由副主席钱三强致开幕词；主席周培源作工作报告；副主席致闭幕词。开会前夕，主持科协日常工作的书记处书记裴丽生（他也是二届副主席之一）带领科协工作人员来钱老办公室，把闭幕词的讲稿拿给他看，征求他的意见，我则坐在一边作记录。
稿子不长，钱老很快看完后说：“这个稿子我没意见，但我建议最后加一段话，说明我不适合担任下届科协主席。你们要是同意加上，这个稿子我念。你们要是不同意，那我就不念，你们另请高明”。谈话的气氛一时有点尴尬。但像裴老这样的老革命家，长期做领导工作，还是很会协调这种难题的。裴老略微思考后说：“学森同志，你看可不可以这么办：你要讲的那段话，不要正式写在文件上。念完闭幕词，你可以在会上讲一段你要说的话”。钱老听后点头同意，这件事就定下来了。
等到闭幕会这一天，致闭幕词。当他念完闭幕词的稿子，开口说：“我要补充一点，说明我本人不适合担任下届科协主席……”他下面的话刚一说出口，台下一片掌声。他再张口讲话，又是一阵热烈掌声。几个回合的“倒彩”使他无法讲下去。就在他又要开口讲话时，突然台下一个人举手，要求发言（当时我未看清是谁），主持会议的周培源主席表示同意。发言者说：“钱老，关于您个人的事情，就不要在大会上讲了”。他的发言又迎来一片更为持久的热烈掌声。讲不下去了，周老立即宣布大会结束。
由于决意不当科协主席，使换届工作进行不下去了。以至于科协第三次全国代表大会不得不推迟召开，80多岁的周培源老先生按章程届满以后还不能退下来，又多当了一年主席。
这就是1984年9月28日给二届科协书记处书记鲍奕珊写信，说他不能当科协“三大”代表的原因（原信见国防工业出版社2007年5月版《书信》第2卷第37页）。一般读者看了这封信会不明白：一个科协三次全国代表大会的代表是什么大事，值得钱老亲自写信请辞？孰不知，他若同意当“三大”代表，必会被选为三届常委，又必会被选为三届主席。接着他会在全国政协接替周培源，成为全国政协副主席，而这，正是他不愿意干的。他常说自己只是一名科技人员，不是一块“当官”的料。如果不是工作需要，他不会同意担任力学所所长，也不会同意担任第五研究院院长、七机部副部长和国防科委副主任等一系列职务。这些职务都是后来在他主动而坚决要求下辞去的。即便当上全国政协副主席能享受“四副两高”党和国家领导人待遇，他也毫不在意。
相关信息：
简要年表
的爱情点滴
的学识与胆识
坎坷的归国之旅
我国著名科学家在京逝世
让当将军赞其“火箭王”